Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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HERC1Q15751 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HERC1Q15751 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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