Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SQLEQ14534 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SQLEQ14534 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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