Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 USP48-212ENST00000527823 554 ntTSL 48.13□□□□□ -1.113e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.3□□□□□ -1.241e-11■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-216ENST00000484087 1495 ntTSL 57.22□□□□□ -1.253e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 IK-210ENST00000523672 556 ntTSL 46.87□□□□□ -1.313e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-215ENST00000478531 1972 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.323e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 IK-202ENST00000502899 690 ntTSL 35.12□□□□□ -1.593e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 REV3L-204ENST00000413831 891 ntTSL 54.93□□□□□ -1.623e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-217ENST00000487825 800 ntTSL 54.72□□□□□ -1.653e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 KIAA1109-206ENST00000424425 3741 ntTSL 24.38□□□□□ -1.715e-9■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.743e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.773e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.093e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 VPS13A-212ENST00000493341 2001 ntTSL 26.06□□□□□ -1.442e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.576e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 RNF213-216ENST00000573548 616 ntTSL 213.52□□□□□ -0.253e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 L3MBTL4-207ENST00000583054 1002 ntTSL 58.49□□□□□ -1.051e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 SNX14-217ENST00000514419 863 ntTSL 319.13■□□□□ 0.652e-8■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 SNX14-204ENST00000369635 2578 ntTSL 516.45■□□□□ 0.222e-8■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 SNX14-214ENST00000509338 505 ntTSL 314.68□□□□□ -0.062e-8■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 SNX14-216ENST00000513869 530 ntTSL 43.54□□□□□ -1.842e-8■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 PDE4D-222ENST00000514552 494 ntTSL 37.08□□□□□ -1.284e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 PDE4D-218ENST00000509368 2809 ntTSL 1 (best)3.08□□□□□ -1.924e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 VPS13C-205ENST00000558088 549 ntTSL 22.7□□□□□ -1.984e-9■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.966e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 MBTD1-202ENST00000405860 3224 ntTSL 512.34□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 MBTD1-206ENST00000591270 2163 ntTSL 26.18□□□□□ -1.422e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 MBTD1-207ENST00000593259 550 ntTSL 53.1□□□□□ -1.912e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.11e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 CCDC144NL-AS1-201ENST00000417232 709 ntTSL 35.97□□□□□ -1.451e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 AL109613.1-205ENST00000446684 714 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.766e-10■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 224.98■■□□□ 1.592e-26■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-218ENST00000471383 969 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-217ENST00000450491 686 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-214ENST00000440732 592 ntTSL 412.85□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-207ENST00000392263 1630 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.29□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-220ENST00000490682 2911 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.573e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 CASP8-201ENST00000264274 2540 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.713e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.441e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.495e-8■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 AC139887.2-203ENST00000503185 618 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-17■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 AC139887.2-204ENST00000503405 550 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-17■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 13.3
HLTFQ14527 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.492e-25■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 LATS1-205ENST00000542720 1096 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.374e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 LATS1-204ENST00000458696 602 ntTSL 315.16■□□□□ 0.024e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.243e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TTC17-208ENST00000526774 3360 ntTSL 1 (best)6.21□□□□□ -1.423e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 PIGZ-201ENST00000238138 868 ntTSL 226.09■■□□□ 1.775e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.75e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.145e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.653e-11■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.593e-11■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.163e-11■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)25.47■■□□□ 1.672e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.858e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TAX1BP1-204ENST00000416801 2221 ntTSL 26.06□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.772e-6■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 28.04□□□□□ -1.121e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.511e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.544e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.554e-7■■□□□ 13.2
HLTFQ14527 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.533e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.183e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAPK14-206ENST00000474429 823 ntTSL 511.25□□□□□ -0.613e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAPK14-208ENST00000491957 2777 ntTSL 1 (best)7.52□□□□□ -1.213e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.33e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAPK14-209ENST00000496250 2750 ntTSL 1 (best)6.82□□□□□ -1.323e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 513.29□□□□□ -0.281e-8■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-8■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 56.6□□□□□ -1.351e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.15□□□□□ -1.751e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 33.96□□□□□ -1.781e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.023e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.793e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 AL109613.1-203ENST00000417401 504 ntTSL 312.45□□□□□ -0.421e-7■■□□□ 13.1
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