Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1CQ13936 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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