Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMB3Q13751 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMB3Q13751 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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