Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RLFQ13129 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLFQ13129 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLFQ13129 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLFQ13129 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLFQ13129 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLFQ13129 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLFQ13129 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RLFQ13129 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RLFQ13129 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLFQ13129 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLFQ13129 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RLFQ13129 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RLFQ13129 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLFQ13129 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RLFQ13129 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RLFQ13129 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLFQ13129 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RLFQ13129 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RLFQ13129 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RLFQ13129 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RLFQ13129 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RLFQ13129 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RLFQ13129 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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