Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC173Q0VFZ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms