Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUDPQ08623 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUDPQ08623 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms