Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITIH3Q06033 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITIH3Q06033 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms