Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLH1Q02575 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms