Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHDQ02161 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHDQ02161 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHDQ02161 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHDQ02161 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHDQ02161 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHDQ02161 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHDQ02161 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHDQ02161 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHDQ02161 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHDQ02161 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHDQ02161 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHDQ02161 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHDQ02161 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHDQ02161 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHDQ02161 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHDQ02161 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHDQ02161 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHDQ02161 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms