Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX1P78414 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX1P78414 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX1P78414 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX1P78414 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX1P78414 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX1P78414 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX1P78414 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms