Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC1P62191 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMC1P62191 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms