Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTBP2P56545 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTBP2P56545 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms