Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB1P54762 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB1P54762 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB1P54762 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms