Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARFIP1P53367 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFIP1P53367 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms