Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LUMP51884 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LUMP51884 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LUMP51884 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LUMP51884 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LUMP51884 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LUMP51884 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LUMP51884 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LUMP51884 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LUMP51884 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LUMP51884 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LUMP51884 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms