Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AMTP48728 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AMTP48728 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMTP48728 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AMTP48728 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AMTP48728 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AMTP48728 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMTP48728 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMTP48728 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMTP48728 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms