Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOP2P46087 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOP2P46087 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOP2P46087 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOP2P46087 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOP2P46087 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOP2P46087 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOP2P46087 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOP2P46087 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOP2P46087 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOP2P46087 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOP2P46087 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOP2P46087 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms