Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDELR1P24390 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR1P24390 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms