Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBG1P23258 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBG1P23258 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms