Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA5P20719 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms