Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms