Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGB6P18564 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms