Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH1P12830 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH1P12830 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH1P12830 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH1P12830 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH1P12830 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH1P12830 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH1P12830 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms