Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGB3P0DN86 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CGB3P0DN86 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms