Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2BP0DMP2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms