Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETP07949 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETP07949 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETP07949 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETP07949 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETP07949 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETP07949 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETP07949 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms