Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUDT3O95989 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUDT3O95989 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms