Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP2O94887 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP2O94887 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP2O94887 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP2O94887 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP2O94887 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP2O94887 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP2O94887 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP2O94887 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARP2O94887 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARP2O94887 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FARP2O94887 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FARP2O94887 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FARP2O94887 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARP2O94887 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP2O94887 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP2O94887 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP2O94887 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP2O94887 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FARP2O94887 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FARP2O94887 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FARP2O94887 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP2O94887 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP2O94887 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP2O94887 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP2O94887 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP2O94887 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP2O94887 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP2O94887 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP2O94887 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP2O94887 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP2O94887 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP2O94887 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP2O94887 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP2O94887 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms