Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDKL5O76039 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL5O76039 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms