Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN3O15232 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN3O15232 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN3O15232 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN3O15232 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN3O15232 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN3O15232 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN3O15232 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN3O15232 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN3O15232 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MATN3O15232 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN3O15232 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN3O15232 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN3O15232 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN3O15232 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN3O15232 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN3O15232 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms