Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK1O15075 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms