Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
O00370 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
O00370 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
O00370 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
O00370 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
O00370 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
O00370 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
O00370 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
O00370 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
O00370 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
O00370 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
O00370 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
O00370 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
O00370 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
O00370 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
O00370 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
O00370 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
O00370 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
O00370 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
O00370 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
O00370 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
O00370 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
O00370 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
O00370 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
O00370 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
O00370 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
O00370 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms