Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F8VRH5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F8VRH5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F8VRH5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F8VRH5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F8VRH5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8VRH5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms