Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF28PB7ZC32 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms