Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KNCNA6PVL3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms