Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC85CA6NKD9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms