Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L3A6NEY3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms