Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A6NDN8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A6NDN8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A6NDN8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A6NDN8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A6NDN8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A6NDN8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A6NDN8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A6NDN8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A6NDN8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A6NDN8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms