Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms