Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00862A6NCI5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00862A6NCI5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms