Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms