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| PTPRJ | Q12913 | LY6G6F-201 | ENST00000375832 | 920 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CRYBB2-201 | ENST00000398215 | 886 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC083873.1-201 | ENST00000421179 | 1099 nt | BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RAD51C-203 | ENST00000421782 | 567 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC006372.1-201 | ENST00000449903 | 546 nt | TSL 2 BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PGAM5-202 | ENST00000454808 | 1084 nt | TSL 3 BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GIMAP6-202 | ENST00000493969 | 876 nt | TSL 2 BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CSRP2-203 | ENST00000547435 | 632 nt | TSL 2 BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SHANK2-AS3-201 | ENST00000307548 | 1683 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CLU-202 | ENST00000405140 | 2098 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PDGFRB-201 | ENST00000261799 | 5717 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.84 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GRB2-203 | ENST00000392562 | 3729 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SLC5A4-201 | ENST00000266086 | 2030 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CCT8-201 | ENST00000286788 | 2005 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HDAC8-207 | ENST00000373573 | 2014 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDX5-210 | ENST00000578804 | 2021 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C12orf56-201 | ENST00000333722 | 3936 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | TMEM248-201 | ENST00000341567 | 4229 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GUCY1B3-202 | ENST00000502959 | 2255 nt | TSL 2 BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ANO6-203 | ENST00000425752 | 3558 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ZBTB26-201 | ENST00000373654 | 2047 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EXOC7-207 | ENST00000411744 | 2031 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ELMOD3-202 | ENST00000393852 | 2332 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR34AHG-203 | ENST00000635687 | 4211 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CPT1C-202 | ENST00000323446 | 2783 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VIPAS39-206 | ENST00000553888 | 2934 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.83 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MTMR9-201 | ENST00000221086 | 7481 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | OCRL-202 | ENST00000371113 | 5162 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | USB1-207 | ENST00000563149 | 1751 nt | TSL 2 BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SEPT6-201 | ENST00000343984 | 2693 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHB5-201 | ENST00000231134 | 3408 nt | APPRIS P1 BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STRC-205 | ENST00000450892 | 5680 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NLGN3-206 | ENST00000612180 | 3319 nt | TSL 5 BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRIM39-204 | ENST00000396548 | 3198 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRIT1-201 | ENST00000316891 | 2112 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HNRNPH1-216 | ENST00000510411 | 2105 nt | TSL 5 BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP000347.1-201 | ENST00000417194 | 5004 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL162615.1-201 | ENST00000429893 | 1653 nt | BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HOPX-211 | ENST00000554144 | 1672 nt | TSL 5 BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SPOUT1-201 | ENST00000361256 | 4286 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SULT1A4-201 | ENST00000360423 | 1390 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LENG8-201 | ENST00000326764 | 3991 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | INCENP-202 | ENST00000394818 | 3964 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ATP1A1-201 | ENST00000295598 | 3654 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GATA2-201 | ENST00000341105 | 3367 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.82 | □□□□□ -0.2 | | |