Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A8P-201ENST00000432432 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LCTL-201ENST00000341509 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BTN2A2-206ENST00000469230 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SVEP1-201ENST00000374461 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLC24A1-202ENST00000339868 5678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 EEF1AKMT3-202ENST00000333012 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 UBA3-203ENST00000415609 2004 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 UBTFL5-201ENST00000443682 1191 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RAP1GAP2-202ENST00000366401 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FMO3-201ENST00000367755 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RBM24-201ENST00000318204 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PAK6-213ENST00000560346 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DUOXA1-208ENST00000558996 2684 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 INPP5K-203ENST00000406424 3194 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LAMA3-203ENST00000399516 9834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DZANK1-201ENST00000262547 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MASP1-201ENST00000169293 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP3-209ENST00000619035 2267 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC01119-202ENST00000468141 2157 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC008663.2-201ENST00000517299 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms