Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DDX3P1-201ENST00000418231 1950 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DCLK2-202ENST00000302176 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC243772.2-201ENST00000428289 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 HHAT-208ENST00000545154 3507 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ENPP5-201ENST00000230565 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 OLFML3-202ENST00000369551 1934 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TPRX1-203ENST00000543508 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 UCP3-201ENST00000314032 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DGCR11-201ENST00000609958 2214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LINC00667-205ENST00000582008 3979 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FAM13C-201ENST00000422313 1963 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL512378.1-201ENST00000394808 2100 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC092447.8-201ENST00000566570 4162 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 C3orf35-201ENST00000328376 1859 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PRDM7-202ENST00000449207 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TMEM100-205ENST00000575734 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CD5-201ENST00000347785 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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