Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC1Q9Y5R8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms