Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-11Q9UQG0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms