Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms