Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDC42EP3Q9UKI2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP3Q9UKI2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms